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1 - Demande: Il sera important de bien identifier le patient par son nom, son prénom, sa date de naissance... Il existe une procédure standard de recherche de cellules et de germes, d'où l'appellation suivante: "Examen cytobactériologique des urines ou ECBU". Celle-ci exclut toute recherche systématique de germes particuliers telle la recherche de BAAR (Bacilles Acido-Alcoolo-Résistants), de leptopsires... Le clinicien ne devra jamais oublier d'indiquer toute demande ou recherche particulière, en raison de l'utilisation de milieux spéciaux. Exemple: La culture du bacille tuberculeux (BAAR) se fera sur le milieu de Lowenstein-Jensen après, au minimum 3 semaines d'incubation à 37°C, le milieu étant protégé de la dessication par un bouchon en caoutchouc. 2 - Examen macroscopique: Toute infection bactérienne s'accompagne, outre la présence de bactéries, de signes biologiques liés à l'inflammation avec l'éventuelle présence de leucocytes, notamment de polynucléaires. Ces éléments peuvent entrainer au delà d'un seuil, une modification visuelle, clairement perceptible à l'oeil nu, qui signe une anomalie patente.
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Qu'est-ce qui est analysé? Les bacilles acido-alcoolo-résistants (BAAR) sont des bactéries (mycobactéries) en forme de bâtonnets (bacilles) qui peuvent être visualisées et dénombrées au microscope après fixation sur lame de verre et coloration spéciale (coloration qui met en évidence les propriétés d'acido-alcoolo-résistance de ces bactéries). La plupart des BAAR appartiennent au genre Mycobacterium. Mycobacterium tuberculosis est la mycobactérie la plus fréquemment rencontrée en pathologie et la plus infectieuse. La plupart des échantillons qui sont adressés pour recherche de BAAR par coloration et culture sont prélevés parce que le médecin suspecte une tuberculose. Seules quelques-unes des plus de 60 espèces de mycobactéries connues entraînent des infections chez l'homme. Parmi celles-ci: • M. africanum entraîne une maladie similaire à la tuberculose, principalement dans certains pays en voie de développement. • Le complexe Mycobacterium avium-intracellulare (MAC), peut entraîner une infection pulmonaire chez les patients immunodéprimés, comme les patients âgés ou les malades du SIDA; cette maladie n'est pas contagieuse d'homme à homme, mais est difficile à traiter du fait de sa résistance habituelle aux antituberculeux.Il est alors possible de suspecter en tenant compte de la réponse Gram+ ou - et des morphologies observées d'évoquer un probable diagnostic Exemples de probables diagnostics bactériologiques en fonction des commémoratifs: suspicion de pneumonie (A), de bronchopneumonie (B), de méningite (C), de pyélonéphrite (D) 3 - 3 Examen après coloration spéciale (Ziehl-Neelsen): Les bacilles acido-alcoolo-résistants (BAAR) compte tenu de la composition de leur paroi sont détectés spécifiquement. Il s'agit du groupe des mycobactéries dont le bacille tuberculeux (Bacille de KOCH/BK) colorées en rouge sur un fonds bleu. Ce contraste de coloration permet une recherche plus facile sur un frottis. D'ailleurs, l'usage actuel d'un colorant fluorescent (auramine) confirme l'intérêt d'une visualisation plus facile (cf GBEA). 3 - 3 Examen après coloration spéciale (MGG): La coloration de May-Grunewald-Giemsa (MGG) est principalement à visée cytologique pour une meilleure individualisation des éléments cellulaires tels polynucléaires, macrophages, lymphocytes...
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Couplées avec un résultat microscopique positif, ces méthodes sont assez sensibles et spécifiques; lorsque la microscopie est négative, elles sont moins pertinentes. Elles sont validées pour les échantillons respiratoires, et doivent être ensuite confirmées par la culture, mais elles fournissent une réponse rapide, permettant au médecin de mettre en isolement les patients potentiellement contagieux et réduire la diffusion de la maladie. Une méthode de culture de M. tuberculosis plus rapide est actuellement en cours d'évaluation. Cette nouvelle méthode par culture en milieu liquide appelée MODS (Microscopic-Observation Drug-Susceptibility assay) permet un diagnostic de tuberculose en 7 jours et fournit en même temps l'antibiotique le plus efficace. En permettant la détection de souches multirésistantes bien plus rapidement que les méthodes classiques, cette technique peut aider les professionnels de santé à diagnostiquer et traiter la maladie à un stade plus précoce et constitue une arme potentielle pour lutter contre la dissémination de la maladie.
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La HAS (Haute Autorité de Santé) a compétence pour donner un avis sur la pertinence de tel ou tel examen de biologie médicale, dans telle ou telle pathologie. Chaque fois qu'il existe un avis de la HAS pour l'examen concerné, nous le signalons par un lien. Vous trouverez toute l'information sur les liens suivants:
Le diagnostic de tuberculose repose sur la mise en évidence du germe ( Mycobacterium tuberculosis, rarement bovis ou africanum). La mise en évidence du germe est souvent difficile (peu nombreux, culture difficile), d'où des prélèvements multiples avec envoi en bactériologie (crachats, tubages gastriques, urines, LCR, etc. ). Si des prélèvements de tissus sont faits, il faut prévoir l'analyse bactériologique et anatomopathologique. 3. 1 - Bactériologie des liquides et prélèvements multiples Examen direct avec coloration de Ziehl (BAAR? ) et d'auramine (immunofluorescence). Culture sur milieux spéciaux solides (Löwenstein-Jensen) ou liquides. Identification du germe (sous-type de mycobactérie). Antibiogramme. 2 Anatomie pathologique En cas de biopsie, il faut aussi envoyer un fragment en anatomie pathologique pour recherche sur les prélèvements fixés en formol et inclus en paraffine de granulomes épithélioïdes et gigantocellulaires avec nécrose caséeuse centrale et coloration de Ziehl. Aspect du granulome (figure 4): association des cellules épithélioïdes (cellules histiocytaires de grande taille, allongées) et des cellules géantes multinucléées autour de la nécrose caséeuse (matériel acellulaire, éosinophile et granuleux).
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